но действительно, а как и когда джейкоб попал на остров?

Черный остался один на острове (может последний из тех, кто всё ранее на острове построил), потом проникает Джейкоб и качает свои права. Типа по аналогии Другие и Дхарма, Уидмор и Бен с новыми другими

ага, поэтому черный превращается в локка и его руками, грубо говоря через бена убивает джейкоба

Можно предположить , что Бен и был лазейкой Черного с самого начала . Черный перевоплотившись в Ричарда , пришел к мини Бену и сказал , что то сможет присоединиться к другим , а это в свою очередь привело к тому , что он помог Саиду бежать , был ранен и попал в лагерь других . Внедрившись , Бен , в силу своего природного таланта к интригам подсидел Удмора и стал главным, затем он же приводит Лока к другим , передает ему лидерство и убивает , благодаря чему Лже Локу удается попасть к Джейкобу и убить его , руками все того же Бена .